人类和猪的基因相似度没有一个适用于所有比较的固定百分比。若比较某些保守基因或蛋白质序列，能看到较高的相似性；若问两种动物的全部DNA有多少碱基完全相同，就必须先说明采用的基因组、比对方法和统计范围。因此，“人和猪的基因相似度是某个确定百分比”并不是完整答案，尤其不能把未经说明的“98%”直接当作全基因组一致率。

先分清三种常被混为一谈的比较

“存在对应基因”不等于“该基因的每个碱基都相同”。同样，某些保守蛋白的序列相似度较高，也不能推算成人类和猪的全部DNA具有相同的比例。不同基因的进化速度不同，基因调控区域、重复序列以及基因组中无法直接对齐的部分，也会影响比较结果。

想核对一个百分比，可以按这几步做

1. 先确定问题对象。准备好要比较的物种——人类（Homo sapiens）和猪（Sus scrofa）——并决定要看某个基因、蛋白质，还是整套基因组。若只想了解一种功能，选定具体基因通常比笼统比较全基因组更有用。
2. 在比较基因组资料中找对应项目。可查看基因组数据库的“比较基因组”“同源基因”或“跨物种基因比较”栏目。比较单个基因时，优先确认列出的是否为对应基因；比较整体时，则找全基因组比对结果及其覆盖范围。
3. 记录统计口径和分母。阅读结果表或方法说明，确认百分比指的是DNA碱基一致性、蛋白质氨基酸一致性，还是具有对应关系的基因比例；同时记下被比对序列的长度和覆盖率。不同基因组版本或比对方法的结果，也不应不加说明地直接并列。
4. 用覆盖率检查数字是否有代表性。一致性描述已对齐部分有多相似，覆盖率描述目标序列有多少参与了比对。举例说，一段序列中只有五分之一成功对齐，即便这部分的一致性很高，也不能据此说整段序列同样接近。完成检查时，应能说清“比的是什么、相同比例怎么算、覆盖了多少”。

序列一致性通常可理解为“比对中相同的位置数÷参与统计的对齐位置数”。因此，看到一个百分比后，还要看它对应的序列长度与覆盖率；只有数字而没有统计对象和分母，无法准确解释其含义。

按用途选择比较口径

• 科普说明物种有哪些共同点：选择“对应基因”或“同源基因”这一口径，并举具体基因或功能作例子。表述重点应是存在进化上的对应关系，不要把它改写成全基因组碱基完全相同的比例。
• 比较某种蛋白或生理功能：选择对应蛋白质或基因序列的一对一比对，并同时报告序列一致性与覆盖率。这样能回答特定分子相似到什么程度，但结论仅适用于该对象。
• 讨论两物种的整体遗传距离：选择全基因组比较，查看可比对区域、序列差异和结构变化。此时应明确分析方法与基因组范围，不用单个基因的结果代替全局结论。

猪与人类确实共享许多具有对应关系的基因，部分保守序列也相当相似；但这并不意味着两种动物在整体遗传信息、身体特征或生理表现上“几乎一样”。判断一个相似度数字是否可信，最实用的检查标准是：它明确写出了比较对象、计算口径和覆盖范围。